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El laboratorio en el diagnóstico molecular de infecciones bacterianas

Respuesta del laboratorio clínico a un simulacro de brote de infecciones bacterianas invasivas: un estudio de preparación. J Clin Microbiol. 2014;52(12):4210-6


Resumen


Los grandes laboratorios clínicos hospitalarios deben estar preparados para investigar rápidamente posibles brotes de enfermedades infecciosas. Con el objeto de desafiar la capacidad del laboratorio de diagnóstico molecular para hacer la secuenciación completa del genoma en un escenario de posible brote, e identificar los obstáculos a estos esfuerzos, se estudiaron 84 cepas de serotipos emm59 del estreptococo invasivo del grupo A (GAS, por su sigla en ingles), recolectadas en los Estados Unidos. Se realizó un ejercicio de respuesta rápida para el escenario de simulacro de brote utilizando secuenciación completa del genoma, análisis del transcriptoma completo del genoma, y estudios de virulencia en ratones. Los cambios de protocolo instalados en respuesta a las lecciones aprendidas fueron probados en una segunda iteración. La investigación inicial fue completada en 9 días. La secuenciación del genoma completo mostró que las infecciones invasivas fueron causadas por múltiples subclones de cepas epidémicas emm59 de GAS, probablemente propagados a los Estados Unidos desde Canadá. El árbol filogenético mostró una estructura temporal-espacial fuerte con diversidad en el contenido del elemento genético móvil, características que son útiles para la identificación de cepas estrechamente relacionadas y posibles eventos de transmisión. Los datos del genoma informaron la epidemiología, identificando múltiples pacientes que probablemente adquirieron los microorganismos a través de la transmisión directa persona-persona. El análisis del transcriptoma reveló inesperadamente la expresión significativamente alterada de genes que codifican un regulador de dos componentes y el factor de virulencia de la cápsula de ácido hialurónico. Los estudios de infección en ratones confirmaron una capacidad de alta virulencia de estos organismos emm 59. La secuenciación del genoma completo, junto con los estudios de análisis del transcriptoma y de virulencia en animales, se pueden realizar rápidamente en un entorno clínico para contribuir de manera efectiva en las decisiones de atención al paciente y decisiones de salud pública.

Bibliografía


En inglés

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Actividad Interactiva
Lo invitamos a observar la siguiente imagen e identificar con letras (A, B, C y D) las opciones señaladas:

Los serotipos emm59 GAS recuperados son altamente virulentos en un modelo de infección en piel y tejidos blandos de ratón en el que causan grandes


Lesiones cutáneas
 
Lesión ulcerada  
Grave necrosis tisular.
Difusión de los márgenes profundos
y lateral
 

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